John J. Dennehy
Ecology as a science evolved from natural history, the observational study of the interactions of plants and animals with each other and their environments. As natural history matured, it became increasingly quantitative, experimental, and taxonomically broad. Focus diversified beyond the Eukarya to include the hidden world of microbial life. Microbes, particularly viruses, were shown to exist in unfathomable numbers, affecting every living organism. Slowly viruses came to be viewed in an ecological context rather than as abstract, disease-causing agents. This shift is exemplified by an increasing tendency to refer to viruses as living organisms instead of inert particles. In recent years, researchers have recognized the critical contributions of viruses to fundamental ecological processes such as biogeochemical cycling, competition, community structuring, and horizontal gene transfer.
PARTE 2 BRENDA TOLEDO
ReplyDeleteLa coinfección permite la recombinación de los diferentes genomas virales. Estas recombinaciones permiten la generación de nuevos genotipos a partir de genotipos parentales y puede ser vista como una forma de reproducción sexual. También se puede dar el parasitismo, ya que algunos virus pueden parasitar recursos de los virus que les ayudan a infectar al hospedero.
La idea de que los virus siempre afectan negativamente a sus hospederos no es del todo cierta, existen interacciones de los virus con ciertas bacterias a las que les facilitan la infección a su hospedero o su reproducción.
Lo más interesante de este artículo fue la sección “coevolución de virus-hospedero”, ya que ambos pueden estar ciclados a través de varios eventos de adaptación y contra adaptación como la hipótesis de la reina roja. Una consecuencia de esta coevolución es que cuando ocurre la transferencia horizontal de genes del virus al genoma del hospedero y éste consigue sobrevivir se genera una resistencia a este virus, quedándose el material genético en el del hospedero e incrementándolo. Estos procesos de transferencia horizontal de genes son muy importantes como fuente de variación genética y evolución
Es muy probable que los virus y los hospederos hayan coevolucionado desde etapas muy tempranas de la vida; por ejemplo los herpes virus aparecieron antes de que los vertebrados surgieran en el Cámbrico. Estos virus pudieron haber acarreado genes importantes que se fueron incorporando al genoma de los demás organismos, alterando también la expresión de los genes existentes, es decir, los virus tienen una gran importancia en las fuerzas evolutivas y ecológicas.
Con todo lo mencionado, la visión que tenía de los virus ha cambiado totalmente a una perspectiva ecológica en la que todo el tiempo nos encontramos interaccionando con ellos de manera positiva, negativa o neutral. Es muy importante esta perspectiva para poder seguir debatiendo si los virus son o no entidades con vida.
Me llamó la atención que el título de esta revisión fuera “What Ecologists can tell Virologists”, debido a que, a lo largo de este artículo, se transmite la idea de que los virus están sujetos a los mismos fenómenos ecológicos que cualquier ser vivo. Entonces, los virus serían modelos de estudio apropiados para los ecólogos, ya que en poco tiempo se pueden tener miles de generaciones de virus en cultivos en el laboratorio, haciendo posible observar en poco tiempo la evolución de éstos. Por lo que se me ocurre la pregunta: “¿Por qué no son más cercanas la Ecología y la Virología?”. Los ejemplos clásicos de la Ecología suelen estar asociados a especies de macroorganismos, como plantas o animales, y pocas veces a microorganismos. La visión utilitarista, desde una perspectiva médica, veterinaria, agronómica, biotecnológica o socioeconómica, del estudio de los virus limita la difusión del conocimiento acerca de estos y su aplicación a otras disciplinas.
ReplyDeleteEn esta revisión se plantean una serie de consideraciones que acercan los campos de la Ecología y de la Virología. Aunque estas ciencias no estén reñidas, es poco habitual encontrarlas coincidiendo en el mismo contexto, ya que los virus se suelen relegar a su estudio como agentes patógenos y la relación que mantienen con sus hospederos. Pero rara vez se presenta a los virus como entidades que evolucionan adaptándose a los ambientes y a nuevas relaciones con organismos. Sin embargo, la preponderancia de la relación virus-hospedero es absoluta, ya sea por el desarrollo de relaciones costo-beneficio (trade-offs), desplazamiento y propagación de las infecciones virales, la coinfección del mismo hospedero por dos o más tipos de virus, hasta la evolución de los genomas de los seres vivos y de los propios virus por la relación de dependencia de estos últimos a la maquinaria de replicación de las células, es el común denominador a lo largo del artículo. Esto tampoco es de extrañar, ya que tradicionalmente, los virus se han considerado como entidades halladas en la frontera entre los seres vivos y la materia inerte, por lo que no se pueden considerar cabalmente sin incluir a los hospederos.
No obstante, a lo largo de la historia de la vida, los virus han jugado un papel importante en la evolución de sus hospederos debido a las interacciones con éstos. Del mismo modo, la evolución de los hospederos y otros virus ha influenciado el desarrollo de genes y de estrategias que llevan a la maximización de las capacidades de reproducción de los virus. Los virus actúan como “jugadores” que arriesgan su capacidad de sobrevivencia y reproducción siguiendo principios básicos de costo-beneficio limitados por la evolución, ya que es imposible crear cosas desde cero, y los genomas y cápsides no pueden ser reconstruidos siguiendo un propósito. Lo que lleva al hecho de que los virus mejor adaptados serían los que mantienen una relación cercana al mutualismo con sus hospederos, en la que el perjuicio que padecen estos últimos es menor y si es posible pueden incluso recibir algún beneficio que en última instancia también favorece al virus. Circunstancia curiosa si se recuerda que el término de virus deriva de una palabra latina que significa “veneno”.
Alejandra Hernández Terán
ReplyDelete04 de Febrero, 2015
What Ecologists Can Tell Virologist
John J. Dennehy
Un virus por definición es una cáscara de proteína llamada cápside que rodea una molécula de ácido nucleico, ésta capa tiene como funciones; brindar estructura, proteger el genoma e introducir éste en las células de un hospedero. El artículo nos habla de cómo estos organismos están sujetos a los mismos principios ecológicos que otros mucho más complejos, lo cual resulta interesante dada toda la discusión sobre la presencia de vida en estos organismos. Esto se vuelve aún más interesante cuando se adentran en las funciones que estos organismos realizan teniendo una forma de replicación simple y un genoma tan pequeño. El artículo menciona la rapidez con la que estos organismos, por selección natural, pueden adaptarse a nuevos ambientes, y dan un ejemplo interesante en el que revelan evolución en sólo 100 generaciones, lo cual, a escalas de macroorganismos es sumamente rápido, y habla de la velocidad en las tasas de mutación en estos organismos.
Unas de las partes que más me interesó del artículo fue la cuestión de los trade-offs, lo cual es básicamente la pérdida o disminución de un atributo a raíz del aumento de otro, debido a que la selección natural no puede maximizar el desempeño de todos los atributos. En este contexto es que se logra la especialización de algunos virus, estos en principio tienden a ser generalistas, pero al haber presiones ambientales de no existir hospederos alternativos, las mutaciones tienden a acumularse y hacer una diferencia en el fitness, por lo que se terminan seleccionando organismos especialistas. La existencia de estos procesos hace más visible que los virus también están sujetos a presiones ecológicas al igual que el resto de los organismos vivos, y que su ambiente dicta los procesos que se llevan a cabo en ellos.
Es también interesante cómo utilizando los métodos de dispersión de organismos más grandes han logrado una distribución tan extensa en el planeta; a pesar de esto, la realidad es que se conoce muy poco acerca de las funciones, y en general de los organismos en sí, actualmente, con las nuevas tecnologías que involucran la secuenciación es que nos damos una idea de lo que nos falta por conocer, ya que como menciona el artículo, de cada muestra analizada, el 70% de las secuencias no corresponden con nada conocido. Estas tecnologías a su vez, ayudan al entendimiento de los procesos en los que estos organismos se ven involucrados y que resultan fundamentales para la estabilidad de los ecosistemas que conocemos.
Por último, me quedo con la frase del artículo en la que mencionan que la existencia de todos estos procesos sólo hace más destacable que los virus logran hacer mucho con muy poco.
Martha Segura G.
ReplyDeleteEvolución de las Interacciones Microbianas, 2015-2
4 febrero 2015
Ensayo 1. Lo que los ecólogos pueden decirle a los virólogos
Soy bióloga de formación. Durante mi paso por la carrera de Biología, aprendí que los virus son estructuras proteicas inertes que encapsulan un ácido nucleico y causan virulencia como estrategia de propagación y sobrevivencia, a organismos eucariontes y procariontes, de todos los grupos biológicos: animales, plantas, algas, hongos, cianoprocariontes y bacterias. Sin embargo, confieso que nunca me había puesto a pensar que los virus tuviesen interacciones complejas con sus hospedadores como coevolución y latencia, y mucho menos competencia con otros virus con quienes se confrontan en el mismo hospedador, como lo indica el trabajo de Dennehy (2014) sobre aspectos ecológicos de los virus.
Un aspecto que me pareció interesante del artículo de Dennehy (2014) fue que en el mundo de los virus, se utilizan los mismos conceptos empleados para describir el comportamiento de otros organismos macroscópicos con sus parásitos y que nos son familiares. Por ejemplo, en la coevolución de tipo reproductivo de los virus con sus hospedadores, la estrategia de reproducción del virus está determinada por la calidad de sobrevivencia del hospedador: si esta calidad es buena, entonces el virus sacrifica su alta tasa de reproducción ante la oportunidad de permanecer seguro y por más tiempo dentro de su hospedador y se convierte en un virus latente. Otro ejemplo de coevolución confirmado a nivel molecular, es que las altas tasas de mutación de algunos virus no son al asar, sino que están direccionada hacia las mutaciones o cambios que sufre el hospedador.
Los ejemplos anteriores se refieren a interacciones entre los virus con sus hospedadores, que es uno de los aspectos de la ecología de los virus, pero ¿cómo interactúan con su medio ambiente y qué función cumplen a nivel de ecosistema? En los ecosistemas acuáticos, los virus tienen influencia en el número y diversidad de sus hospederos y ayudan al reciclaje de materia orgánica al provocar la muerte de macro y microzooplancton, fitoplancton y bacterias heterotróficas, de manera que sus restos celulares se convierten en materia orgánica disuelta, que a su vez es aprovechada por las bacterias heterótrofas Wilhelm and Suttle (1999).
Referencias
Dennehy, J J. What ecologists can tell virologists. Ann. Rev. Microbiol. 2014. 68: 117-35.
Wilhelm S and Suttle C A. Viruses and nutrients cycles in the sea. BioScience. 1999. 49 (10): 781-788.
Alan Enrique Heres Rojas
ReplyDelete3/febrero/2015
What Ecologists Can Tell Virologists
Los virus son acelulares y están constituidos esencialmente por un armazón proteico en el cual se encuentran protegidos los ácidos nucleicos de su genoma. En su genoma relativamente pequeño, esta codificada toda la información requerida para su autoreplicación y ensamblaje dentro de la célula hospedadora. En apariencia los virus son sencillos, sin embargo, tienen una alta capacidad de hacer frente a una gran diversidad de ambientes, y es esta misma diversidad ambiental es la que determina el diseño de la partícula viral.
En general los virus se adaptan a las circunstancias ambientales en las que vive su hospedero, este hecho es relevante desde el punto de vista ecológico ya que es posible inferir las características básicas de las partículas virales en base al nicho ecológico de donde son aislados. Por otro lado, la heterogeneidad de las condiciones ecológicas en el tiempo y espacio así como las restricciones en la supervivencia de los virus y su función en ciertos nichos ecológicos, pueden ayudar a predecir los patrones de incidencia de ciertas enfermedades.
Estudios recientes han demostrado que los virus están sujetos a los mismos principios evolutivos que el resto de los organismos vivos, es decir, a la selección natural, a la especialización, entre otros, además, se ha observado que el incremento en la especialización de algunos rasgos esta correlacionado al decremento de otros rasgos, lo que se conoce como tade-offs (compensaciones). Muchos de los trade-offs en virus están sujetos o son el resultado de las restricciones o por la limitación en el diseño propio del virus. Estas compensaciones son estudiadas en función de la adecuación o fitness generalmente midiendo la supervivencia de la partícula viral o su capacidad para reproducirse. Los trade- offs en virus están sirviendo para explicar fenómenos como la especialización a los hospederos, el tropismo tisular (especialización del tejido a infectar) y la capacidad patogénica.
Otro rasgo ecológico importante acerca de los virus es su capacidad de desplazamiento, esto es importante dado que es posible inferir la manera en la que incide una enfermedad. Generalmente el desplazamiento de los virus está determinado por las características físicas del medio en que se encuentran y están sujetos a los mismos principios que rigen el movimiento a nivel molecular.
Recientemente, ha sido posible estudiar la diversidad y distribución de los virus gracias al desarrollo de técnicas modernas de secuenciación (genómica). Los estudios genómicos han revelado que al menos el 70% de las secuencias generadas no muestran homología con otras secuencias lo cual nos hable de una alta diversidad en el mundo de los virus.
Por otro lado, los virus también están sujetos a la competencia con otros miembros de su grupo, sin embargo, su alta capacidad de adaptarse y especializase ha permitido generar la hipótesis de que única limitante es la disponibilidad de hospederos a los cuales infectar. En este sentido se sabe que los virus coevolucionan junto con su hospedero y que en muchos de los casos ha contribuido o “dirigido” la propia evolución de su hospedero.
1. What ecologists can tell virologists
ReplyDeleteGrisel Córdova Villalba
Aunque tradicionalmente los virus han sido considerados sólo como agentes patógenos y como partículas inertes, en este artículo se les aprecia desde una perspectiva ecológica, pues intervienen en procesos ecológicos fundamentales como la estructura de las comunidades, la competencia, la transferencia horizontal de genes y por lo tanto tienen un papel importante en la biodiversidad.
Para lograr lo anterior primero deben tener una estructura que sea lo suficientemente flexible y a la vez lo suficientemente fuerte, para que les permita sobrevivir en ambientes tanto dentro como fuera de los hospederos. Así que los virus tendrán una fuerte presión selectiva para características que les permitan resistir los dos tipos de ambientes lo cual, puede comprometer otras características, por ejemplo disminuir su reproducción.
Estos compromisos o trade-offs, son especializaciones de los virus en respuesta a un ambiente específico. Los trade-offs pueden suceder por pleiotroía, selección direccional, acumulación de mutaciones o bien a restricciones físicas o genéticas.
Sucede algo curioso con los virus, pues a pesar de no ser tan complejos son capaces de sensar el ambiente y “saber” cuál es momento adecuado para infectar hospederos. También es curioso que a pesar de no tener medios de motilidad, virus casi idénticos se encuentren a miles de kilómetros de distancia, lo cual se debe principalmente a que “viajan” por convección en los cuerpos de agua y aire, y depende de ciertos factores como su tamaño, su forma, su densidad y la viscosidad del med.
Se estima que el número de virus en la biosfera sea alrededor de 10ˆ31. Por metagenómica se han identificado una gran diversidad de los virus, y un 70% de las secuencias generadas en estos estudios no presentan homología.
Se tiene esta diversidad en los virus, a pesar de que existe competencia entre ellos, que se da a nivel externo o interno del hospedero. Esta competencia se vuelve más trascendente cuando un virus intenta colonizar nuevas áreas geográficas pues las cepas endémicas pueden impedirlo.
También se dan casos de mutualismo, ya sea entre los virus para incrementar la patogénesis o la transmisión, o bien entre los virus y el hospedero. Los virus se comportan de manera mutualista si esto incrementa más su adecuación que estrategias “abusivas”, la selección natural favorecerá a los virus que tengan una mejor transmisión, sin importar cuál sea su estrategia.
A partir de estas interacciones entre hospederos y virus se llega a un proceso de coevolución. En el caso de los virus que dañan al hospedero surge una carrera armamentista o la adaptación y contraadaptación cíclica de la Reina Roja. Esta coevolución va a dar lugar a los polimorfismos, es decir, a la variación genética, que permitirá la evolución adaptativa, afectando características como la selección sexual en el caso del MHC.
Otra forma de interacciones con virus es la transferencia horizontal de genes lo que tendrá repercusiones en la sobrevivencia, competencia así como en las interacciones interespecíficas. Se ha observado que el 20% de los genomas bacterianos proviene de profagos, mientras que el 50% del genoma de mamíferos y el 90% del de plantas proviene de elementos genéticos móviles y de virus endógenos. Estos datos llevan a pensar que una gran cantidad de genes en la biosfera están contenidos en los virus y que son un buen ejemplo de “genes egoístas” que utilizan a los organismos como máquinas de reproducción y se comportan con ellas como mejor les convenga, de manera mutualista o bien de manera “abusiva”, dependiendo de con cuál de las dos estrategias la reproducción de ellos se vea favorecida, o encontrando un equilibrio entre ambas.
Efecto del entorno en la ecología y selección de virus
ReplyDeleteEl entorno es un factor fundamental en el desarollo, papel ecológico y evolución de los organismos. Los virus deben de ser capaces de desarollarse en dos entornos: el exterior donde buscan nuevos hospederos y el interior donde se replican.
En el entorno exterior los virus deben superar barreras fisicas como la viscocidad del medio, la difusión, la diseccion o los rayos UV. Estas barreras físicas, y la capacidad de viajar y sobrevivir, determinan la distribución de los virus. Aunque algunos virus se encuentran en todas partes otros son muy localizados. Esta distribución geográfica puede verse afectada por hospederos migratorios o por cambios en el entorno.
El entorno interno esta compuesto no solo por el hospedero, si no por otros virus con los que se pueda entrar en competencia. Este entorno ejerce presiones selectivas sobre el virus. Estas presiones pueden llevar a simbiosis con el organismo, o a competencia con otros virus que puede ser potencialmente letal para el hospedero.
Aunque puede parecer que los organismos se enfrentan a dos entornos, estos pueden ser mas. El entorno externo es ampliamente variable. Además, muchos virus tienen mas de un hospedero, cada uno con caracteristicas diferentes. Esto puede llevar a selección para varios entornos y a generaliastas, los cuales pueden enfrentarse a varios entornos y hospederos. Otra opción son los especialistas, los cuales han sido seleccionados para un hospedero específico, sin embargo, si algo pasa a ese hospedero elloa tambien se ven severamente afectados. Una pregunta interesante es que tanto los transposones son virus que se integraron al hospedero para evitar el contender con el entorno externo.
El estudio de las interacciones es un asunto de gran interés en la ecología contemporánea, sin embargo no es un tema sencillo de abordar, menos aun cuando se está interesado en las interacciones entre microorganismos. Una enorme desventaja al tratar de estudiar las interacciones entre microorganismos (y en realidad al tratar de estudiar casi cualquier cosa referente a la biología de éstos) es escaso éxito que se ha tenido para cultivar a estos seres in vitro, se estima que tan sólo el 1% de las bacterias son cultivables bajo la mayoría de los métodos actualmente utilizados. Debido a esto, la metagenómica ha cobrado gran importancia en el estudio de los microorganismos y sus interacciones, ya que ha permitido estudiar de forma indirecta aun a las bacterias no cultivables. Sin embargo, como cualquier otra técnica, la metagenómica tiene limitaciones y complicaciones, y para el estudio de interacciones microbianas, el análisis y la interpretación de los datos obtenidos cobra una dificultad notable.
ReplyDeleteDada la importancia del manejo de los datos y lo delicado que resulta su análisis, el artículo de Faust y Raes repasa distintas aproximaciones metodológicas útiles en esta labor. Se describen las capacidades y limitaciones de varios tipos de análisis, así como las ventajas y desventajas de usar algunos métodos sobre otros. Un aspecto importante repasado en el artículo es la inferencia de redes y el uso de éstas para desplegar los resultados obtenidos tras el análisis de datos sobre interacciones. Las redes proporcionan un elemento sumamente útil y hasta estético para representar las interacciones porque permiten representar una gran cantidad de información en un formato compacto y sencillo de leer si se posee el entrenamiento necesario. Pese a la superioridad de este formato, la dificultad subyace en su realización: desarrollar una red que contenga información verídica y confiable, implica un cuidadoso nivel de análisis. En el escrito se describen dos tipos de inferencia dónde uno permite analizar relaciones de dos vías y otro permite estudiar interacciones más complejas en donde hay más de dos participantes influyendo entre sí. Siendo que refleja mejor los eventos como ocurren de forma natural, el análisis de relaciones complejas es por mucho el más atractivo, sin embargo es también en el que resulta más fácil hacer inferencias que aún siendo estadísticamente significativas pudieran no ser biológicamente relevantes. De igual forma el artículo nos insta a recordar que la mayoría de los estudios de interacciones son estáticos y por lo tanto no representan fielmente el comportamiento de una población a lo largo del tiempo, por lo que resalta la relevancia de mejorar los modelos actuales para hacerlos dinámicos y así poder tener un acercamiento más real en el estudio de las interacciones microbianas.
Todos los aspectos tocados en la revisión son sumamente importantes para el correcto estudio de las interacciones microbianas, sin embargo con las tecnologías y modelos actuales es aún muy complejo alcanzar las expectativas deseadas en cuanto al estudio de interacciones complejas. La principal limitación es la incapacidad actual para cultivar los microoganismos que usualmente se encuentran interaccionando in situ, será de gran relevancia para el futuro del campo de la ecología de interacciones microbianas el poder ampliar el espectro de organismos cultivables. Es necesario implementar nuevas metodologías que permitan estudiar bajo condiciones controladas los organismos a los que hoy en día no tenemos acceso por su dificultad de cultivo; en la literatura reciente han sido reportados casos de éxito en este aspecto, tal es el caso tan sonado del descubrimiento del género Aquabacteria, productor del antibiótico teixobactin. Ejemplos como el de Aquabacteria demuestran que no es imposible cultivar a las bacterias “incultivables” sino que sólo ha faltado creatividad por parte de la comunidad científica, impedimento que debe ser superado si desea estudiar con mayor detalle la ecología de las interacciones microbianas.
Visto desde la perspectiva propia de los virus, este ensayo trata sobre la importancia ecológica y como contribuyen en los ciclos biogeoquímicos, competencia, estructura poblacional y transferencia horizontal.
ReplyDeleteLos virus tienen que sobrevivir entre dos ambientes separados por la membrana del hospedero. Afuera se enfrentan a ambientes variables y su objetivo es sobrevivir hasta encontrar un nuevo hospedero, por lo que el diseño de la partícula viral está hecha para soportar estas variaciones físico-químicas del ambiente.
La especialización está basada en el supuesto de que la selección natural no puede maximizar el rendimiento de todos los caracteres al mismo tiempo, un aumento en el éxito de un carácter está relacionado con una disminución en otro. Estos trade-offs son el resultado de restricciones físicas o limitaciones en el diseño. Algunos ejemplos son : el trade-off entre supervivencia y reproducción, entre velocidad de ensamble del cápside y su dureza, entre el número de progenie y tiempo de generación y entre lisogenia y lísis. La teoría de optimización y trade-offs también tiene un impacto en la patogenia viral: la selección va a favorecer la transmisión sin minimizar la virulencia, siempre y cuando el exceso de virulencia no reduzca la transmisión. A este fenómeno se le conoce como “atenuación”. Desde el punto de vista del virus el mundo es captado a través de moléculas “proxy”, las decisiones las hacen de forma probabilística. Un ejemplo es el uso del fago λ de la molécula RecA producida por la bacteria para poder estimar su estado fisiológico, bacterias que producen mucho RecA están muy activas y representan un enorme chance para que el profago comience su fase lítica e infecte nuevas células.
Los virus se mueven por difusión aleatoria. El coeficiente de difusión de un virus depende de su tamaño y forma y de la interacción y viscosidad del solvente. Los encuentros con sus hospederos depende de la densidad poblacional de ambos. Subiéndose al agua o viento los virus tienen una enorme capacidad de movimiento independiente de su hospedero. Los virus pueden viajar a grandes velocidades a través de miles de kilómetros, del Sahara al Amazonas en un día! El estimado del número de virus en la biósfera es de 1031 que representa 7 órdenes de magnitud más que el número de estrellas en nuestro universo! La metagenómica ha revelado una enorme diversidad viral escondida: 70% de las secuencias generadas no poseen homología con nada conocido!
La causa principal de la distribución de los virus es la competencia por los hospederos. Observaciones de virus aparentemente similares en el mismo hábitat (violación del principio de exclusión de Gausse) probablemente se deba a pequeñas pero significativas variaciones del microhábitat. Existen interacciones mutualistas entre los virus y sus hospederos donde los virus protegen a sus hospederos si les aumentan su capacidad de transmisión.
La adquisición de resistencia de los hospederos hace que los virus adquieran alguna forma de contradefensa entrando así en una carrera armamentista o en una dinámica estilo Reina Roja. Una consecuencia de este tipo de coevolución es la adquisición de variabilidad genética. La variación genética y la diferenciación poblacional afectan a la evolución de las especies. Los virus y sus hospederos probablemente han evolucionado juntos desde el comienzo de la vida, esto se puede ver en los árboles filogenéticos que coinciden.
Se discute la importancia de la transferencia horizontal de genes en la sobrevivencia, competencia, interacciones interespecíficas y estructura de las comunidades y aconseja que se estudie desde un punto de vista ecológico. Los virus son mediadores del HGT y sus genomas poseen una variedad de información genética de diversas fuentes (mosaicismo). Extrapolando datos publicados se sugiere que 1024 genes son transportados anualmente por los virus a sus hospederos! La importancia de la HGT mediada por los virus sugiere que los virus pueden aumentar la capacidad evolutiva de sus hospederos.